En novembre 1999, la Polo a fait peau neuve pour une troisième génération intégralement revue : nouveau regard, nouvelle ligne, nouveaux moteurs et nouveaux équipements. A mi-chemin entre la Lupo (intérieur) et la Golf (extérieur), la nouvelle Polo trouve parfaitement sa place au sein de la gamme Volkswagen. Même si la planche de bord est classique et manque d'une pointe de fantaisie, l'habitacle est bien fini et les équipements sont nombreux : répartiteur de freinage couplé à l'ABS, airbags frontaux, direction assistée...Lors de ce restylage, la Polo III a également été dotée d'une nouvelle gamme de motorisations : 1,4L (16V ou non) et 1,6L (GTI 125ch uniquement en 3 portes) essence, 1,4L TDI (qui, selon Volkswagen, ne consommerait que 4,4L au 100km) et 1,9L SDI diesel.